稅收是國家財政收入的主要來源，是國家發展公益事業，促進經濟和社會全面發展及實現國家管理職能的基本保證。一切經濟組織和公民都有依法納稅的義務。個人獨資企業從事經營活動應當依法履行納稅義務。
關于個人獨資企業及其投資人的所得稅負擔問題，在制定個人獨資企業法的過程中始終是各方關注的焦點問題之一。按照現行企業所得稅暫行條例的規定，個人獨資企業應當根據其應稅所得額繳納33％的企業所得稅。同時，按照個人所得稅法的規定，個人獨資企業的投資人從企業分得的利潤還要繳納20％的個人所得稅。本辦法生效后，將有部分具備條件的個體工商戶轉為個人獨資企業，而他們過去只按應稅所得額5—35％的超額累計稅率繳納個人所得稅，轉為個人獨資企業后，要繳納二道稅，將加重他們的稅負。對此，許多全國人大常務委員會委員在審議個人獨資企業法（草案）時提出，對個人獨資企業應當只收一道稅，避免雙重征稅。經研究，全國人大法律委員會認為，對個人獨資企業如何征稅問題情況比較復雜，涉及我國現行稅收制度的調整和完善，需要在制定稅法時通盤考慮。因此，只對個人獨資企業依法履行納稅義務作了規定。目前，國家有關部門已經注意到雙重征稅對個人獨資企業發展的影響，正在著手研究解決這一問題。但在問題解決之前，個人獨資企業仍應依法履行納稅義務。
